overgangsalderen forekommer naturlig når en kvinnes eggstokkene går tom for å virke egg. Ved fødselen har de fleste kvinner ca 1 til 3 millioner egg, som gradvis går tapt gjennom en kvinnes liv. På tidspunktet for jenters første menstruasjonsperiode har de et gjennomsnitt på ca 400.000 egg. Ved overgangsalderen kan en kvinne ha færre enn 10.000 egg. En liten prosentandel av disse eggene går tapt gjennom normal eggløsning (den månedlige syklusen). De fleste egg dør av gjennom en prosess som kalles atresia.
Normalt, FSH eller follikkelstimulerende hormon (et reproduktivt hormon), er stoffet som er ansvarlig for veksten av eggstokksekkene (egg) i løpet av første halvdel av en kvinnes menstruasjonssyklus. Som overgangsalderen nærmer seg, blir de resterende eggene mer motstandsdyktige mot FSH, og eggstokkene dramatisk reduserer produksjonen av et hormon som kalles østrogen.
østrogen påvirker mange deler av kroppen, inkludert blodårene, hjerte, bein, bryster, livmor, Urinsystem, hud og hjerne. Tap av østrogen antas å være årsaken til mange av symptomene forbundet med overgangsalderen. På tidspunktet for overgangsalderen reduseres eggstokkene også sin produksjon av testosteron – et hormon involvert med sexdrift.